在高新技術(shù)企業(yè)登陸主板市場(chǎng)的同時(shí)，專門針對(duì)科技型企業(yè)設(shè)立的創(chuàng)業(yè)板也初見端倪。1999年，中小企業(yè)板市場(chǎng)深交所向證監(jiān)會(huì)呈交《深圳證券交易所關(guān)于進(jìn)行成長板市場(chǎng)的方案研究的立項(xiàng)報(bào)告》。

2000年，國務(wù)院批準(zhǔn)證監(jiān)會(huì)關(guān)于設(shè)立二板的請(qǐng)示后，將二板市場(chǎng)命名為創(chuàng)業(yè)板市場(chǎng)。2000年，中小企業(yè)板市場(chǎng)深交所成立創(chuàng)業(yè)板市場(chǎng)發(fā)展戰(zhàn)略委員會(huì)、國際專家委員會(huì)兩個(gè)委員會(huì)和八個(gè)職能部門，創(chuàng)業(yè)板市場(chǎng)組織架構(gòu)基本建立。2003年，黨的十六屆三中全會(huì)提出“規(guī)范和發(fā)展主板市場(chǎng)，中小企業(yè)板市場(chǎng)推進(jìn)風(fēng)險(xiǎn)投資和創(chuàng)業(yè)板市場(chǎng)建設(shè)”。2004年，深交所正式推出中小企業(yè)板。中小企業(yè)板為那些暫時(shí)不符合主板上市要求的中小企業(yè)、科技型企業(yè)提供融資服務(wù)，也為風(fēng)險(xiǎn)資本提供市場(chǎng)退出渠道。其中小企業(yè)板市場(chǎng)上市門檻雖然較后來創(chuàng)業(yè)板市場(chǎng)要高，中小企業(yè)板市場(chǎng)阻礙了一些小規(guī)模科技型企業(yè)參與其中，但仍然是科技型企業(yè)資本市場(chǎng)融資的有益探索，為后來創(chuàng)業(yè)板市場(chǎng)提供了豐富經(jīng)驗(yàn)。