股權結構決定和影響公司治理。由于國有上市公司股權結構的自身特點，國有上市公司有哪些？導致其形成了Berle和Means最早發現，隨著現代公司制的發展，公司所有權與經營權發生分離趨勢。公司所有權與經營權的分離引發了委托—代理問題；而從契約經濟學角度而言，這是由于契約的不完善性引起的。解決委托—代理問題的根本是如何降低代理成本。國有上市公司整個公司治理實質上就是如何解決委托—代理關系中所存在的利益相關者關系問題。

委托—代理理論發展至今，主要涉及兩個方面的問題：第一，所有者與經營者之間的利益關系問題，國有上市公司這是最核心、最本質的委托—代理問題；第二，大股東與小股東之間的關系問題。對我國國有上市公司而言，主要的委托—代理問題是所有者與經營者之間的利益關系問題即核心委托—代理問題。中國的國有企業，其所有者是全體勞動人民，在事實上由相關政府部門代表全民行使所有權。國資委及國有資產經營管理機構或投資機構等是國有資產的實際所有者，負責管理和經營國有資產，國有上市公司行使具體所有權。與民營上市公司既有共性又有特殊性的公司治理問題。這些問題主要表現在以下方面。